Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRM2P04554 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PRM2P04554 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRM2P04554 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRM2P04554 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PRM2P04554 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PRM2P04554 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRM2P04554 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRM2P04554 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRM2P04554 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRM2P04554 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms