Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC4A1P02730 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A1P02730 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms