Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
APOC1P02654 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
APOC1P02654 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC1P02654 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC1P02654 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC1P02654 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC1P02654 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC1P02654 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC1P02654 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC1P02654 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC1P02654 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC1P02654 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC1P02654 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC1P02654 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
APOC1P02654 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
APOC1P02654 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC1P02654 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC1P02654 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC1P02654 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC1P02654 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC1P02654 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC1P02654 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC1P02654 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
APOC1P02654 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
APOC1P02654 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
APOC1P02654 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC1P02654 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC1P02654 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC1P02654 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC1P02654 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC1P02654 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC1P02654 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC1P02654 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
APOC1P02654 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms