Protein–RNA interactions for Protein: P01737

T-cell receptor alpha chain V region PY14, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01737 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01737 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01737 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01737 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01737 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01737 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01737 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01737 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01737 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01737 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01737 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01737 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01737 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms