Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFRP00533 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFRP00533 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFRP00533 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFRP00533 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFRP00533 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFRP00533 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFRP00533 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFRP00533 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFRP00533 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EGFRP00533 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EGFRP00533 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
EGFRP00533 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EGFRP00533 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFRP00533 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFRP00533 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFRP00533 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFRP00533 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFRP00533 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFRP00533 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFRP00533 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFRP00533 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EGFRP00533 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFRP00533 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFRP00533 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFRP00533 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFRP00533 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFRP00533 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFRP00533 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFRP00533 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EGFRP00533 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EGFRP00533 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EGFRP00533 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFRP00533 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFRP00533 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFRP00533 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFRP00533 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFRP00533 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFRP00533 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFRP00533 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFRP00533 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFRP00533 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EGFRP00533 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms