Protein–RNA interactions for Protein: O95714

HERC2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, humanhuman

Predictions only

Length 4,834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2O95714 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
HERC2O95714 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC2O95714 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC2O95714 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC2O95714 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC2O95714 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HERC2O95714 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HERC2O95714 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
HERC2O95714 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HERC2O95714 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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HERC2O95714 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC2O95714 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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HERC2O95714 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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HERC2O95714 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HERC2O95714 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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HERC2O95714 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HERC2O95714 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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