Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRATO95237 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRATO95237 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRATO95237 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRATO95237 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRATO95237 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRATO95237 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRATO95237 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LRATO95237 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRATO95237 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRATO95237 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRATO95237 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRATO95237 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRATO95237 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRATO95237 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRATO95237 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRATO95237 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRATO95237 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRATO95237 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRATO95237 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRATO95237 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRATO95237 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRATO95237 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRATO95237 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRATO95237 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRATO95237 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRATO95237 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRATO95237 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms