Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLSTN1O94985 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLSTN1O94985 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms