Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEBLO76041 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEBLO76041 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEBLO76041 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEBLO76041 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEBLO76041 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEBLO76041 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEBLO76041 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEBLO76041 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEBLO76041 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEBLO76041 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEBLO76041 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEBLO76041 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEBLO76041 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEBLO76041 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEBLO76041 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEBLO76041 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEBLO76041 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEBLO76041 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEBLO76041 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEBLO76041 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEBLO76041 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEBLO76041 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEBLO76041 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEBLO76041 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEBLO76041 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEBLO76041 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEBLO76041 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms