Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIOO75962 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIOO75962 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIOO75962 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIOO75962 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIOO75962 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIOO75962 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIOO75962 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIOO75962 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIOO75962 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIOO75962 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIOO75962 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIOO75962 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIOO75962 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIOO75962 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIOO75962 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIOO75962 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIOO75962 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIOO75962 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIOO75962 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIOO75962 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIOO75962 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIOO75962 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIOO75962 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIOO75962 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIOO75962 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIOO75962 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIOO75962 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIOO75962 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIOO75962 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIOO75962 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIOO75962 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIOO75962 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIOO75962 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIOO75962 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIOO75962 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIOO75962 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIOO75962 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIOO75962 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIOO75962 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIOO75962 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIOO75962 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIOO75962 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIOO75962 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIOO75962 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIOO75962 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIOO75962 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIOO75962 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIOO75962 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms