Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNKO75909 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNKO75909 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNKO75909 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNKO75909 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCNKO75909 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCNKO75909 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCNKO75909 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCNKO75909 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCNKO75909 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCNKO75909 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCNKO75909 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNKO75909 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNKO75909 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNKO75909 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms