Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH16O75309 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH16O75309 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH16O75309 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH16O75309 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH16O75309 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH16O75309 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH16O75309 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH16O75309 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH16O75309 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH16O75309 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH16O75309 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDH16O75309 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDH16O75309 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDH16O75309 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDH16O75309 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH16O75309 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH16O75309 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH16O75309 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH16O75309 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH16O75309 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH16O75309 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH16O75309 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH16O75309 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH16O75309 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDH16O75309 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDH16O75309 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDH16O75309 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms