Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRP5O75197 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRP5O75197 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRP5O75197 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRP5O75197 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRP5O75197 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRP5O75197 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
LRP5O75197 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRP5O75197 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRP5O75197 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRP5O75197 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRP5O75197 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRP5O75197 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRP5O75197 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRP5O75197 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRP5O75197 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRP5O75197 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRP5O75197 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRP5O75197 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRP5O75197 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRP5O75197 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRP5O75197 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRP5O75197 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRP5O75197 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRP5O75197 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRP5O75197 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRP5O75197 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRP5O75197 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRP5O75197 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRP5O75197 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRP5O75197 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
LRP5O75197 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRP5O75197 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRP5O75197 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRP5O75197 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRP5O75197 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LRP5O75197 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRP5O75197 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRP5O75197 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRP5O75197 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRP5O75197 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRP5O75197 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRP5O75197 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRP5O75197 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRP5O75197 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRP5O75197 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRP5O75197 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRP5O75197 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRP5O75197 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP5O75197 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP5O75197 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP5O75197 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP5O75197 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP5O75197 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP5O75197 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP5O75197 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP5O75197 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP5O75197 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP5O75197 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP5O75197 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRP5O75197 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP5O75197 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP5O75197 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP5O75197 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP5O75197 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP5O75197 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP5O75197 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP5O75197 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP5O75197 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP5O75197 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP5O75197 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP5O75197 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRP5O75197 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRP5O75197 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRP5O75197 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRP5O75197 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRP5O75197 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRP5O75197 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRP5O75197 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRP5O75197 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRP5O75197 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRP5O75197 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRP5O75197 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRP5O75197 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRP5O75197 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRP5O75197 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRP5O75197 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms