Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBNO60934 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBNO60934 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NBNO60934 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBNO60934 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBNO60934 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBNO60934 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBNO60934 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBNO60934 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBNO60934 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBNO60934 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBNO60934 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBNO60934 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBNO60934 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBNO60934 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBNO60934 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBNO60934 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBNO60934 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NBNO60934 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NBNO60934 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NBNO60934 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBNO60934 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBNO60934 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBNO60934 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBNO60934 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBNO60934 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBNO60934 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NBNO60934 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NBNO60934 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NBNO60934 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms