Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
ABCC9O60706 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC43.07■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC43.05■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC43.02■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
ABCC9O60706 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC43■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC43■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC42.98■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.95■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
ABCC9O60706 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC42.92■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC42.92■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC42.92■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
ABCC9O60706 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms