Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SMARCA5O60264 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SMARCA5O60264 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms