Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYNGR1O43759 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYNGR1O43759 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.3 ms