Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD51CO43502 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAD51CO43502 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms