Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATMINO43313 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATMINO43313 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATMINO43313 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATMINO43313 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATMINO43313 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATMINO43313 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATMINO43313 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATMINO43313 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATMINO43313 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATMINO43313 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATMINO43313 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATMINO43313 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATMINO43313 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATMINO43313 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATMINO43313 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATMINO43313 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATMINO43313 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATMINO43313 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATMINO43313 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMINO43313 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMINO43313 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMINO43313 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMINO43313 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMINO43313 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMINO43313 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMINO43313 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMINO43313 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMINO43313 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMINO43313 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATMINO43313 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATMINO43313 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMINO43313 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMINO43313 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMINO43313 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMINO43313 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMINO43313 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMINO43313 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMINO43313 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMINO43313 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMINO43313 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMINO43313 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATMINO43313 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMINO43313 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMINO43313 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMINO43313 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMINO43313 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATMINO43313 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms