Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPATO15228 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPATO15228 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPATO15228 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPATO15228 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPATO15228 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPATO15228 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPATO15228 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPATO15228 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPATO15228 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPATO15228 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GNPATO15228 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPATO15228 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPATO15228 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPATO15228 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPATO15228 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPATO15228 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPATO15228 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GNPATO15228 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPATO15228 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPATO15228 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPATO15228 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPATO15228 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPATO15228 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPATO15228 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GNPATO15228 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GNPATO15228 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GNPATO15228 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPATO15228 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPATO15228 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPATO15228 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPATO15228 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPATO15228 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPATO15228 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPATO15228 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPATO15228 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GNPATO15228 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GNPATO15228 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GNPATO15228 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GNPATO15228 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GNPATO15228 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPATO15228 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPATO15228 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPATO15228 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GNPATO15228 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms