Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
POLR1CO15160 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR1CO15160 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms