Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SYNMO15061 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYNMO15061 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYNMO15061 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYNMO15061 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYNMO15061 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYNMO15061 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SYNMO15061 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNMO15061 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNMO15061 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNMO15061 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNMO15061 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNMO15061 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNMO15061 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNMO15061 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNMO15061 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNMO15061 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNMO15061 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SYNMO15061 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
SYNMO15061 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYNMO15061 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYNMO15061 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
SYNMO15061 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYNMO15061 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYNMO15061 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
SYNMO15061 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYNMO15061 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYNMO15061 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SYNMO15061 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNMO15061 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNMO15061 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNMO15061 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNMO15061 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNMO15061 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SYNMO15061 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNMO15061 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNMO15061 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNMO15061 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNMO15061 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNMO15061 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNMO15061 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNMO15061 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNMO15061 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNMO15061 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNMO15061 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SYNMO15061 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNMO15061 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNMO15061 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNMO15061 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNMO15061 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNMO15061 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNMO15061 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNMO15061 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNMO15061 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SYNMO15061 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNMO15061 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNMO15061 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNMO15061 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNMO15061 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNMO15061 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNMO15061 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNMO15061 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNMO15061 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNMO15061 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNMO15061 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNMO15061 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SYNMO15061 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNMO15061 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNMO15061 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNMO15061 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNMO15061 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SYNMO15061 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYNMO15061 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYNMO15061 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYNMO15061 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SYNMO15061 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms