Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC27A2O14975 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC27A2O14975 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC27A2O14975 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms