Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IKBKBO14920 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IKBKBO14920 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms