Protein–RNA interactions for Protein: O14830

PPEF2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF2O14830 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF2O14830 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF2O14830 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF2O14830 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF2O14830 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF2O14830 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF2O14830 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF2O14830 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF2O14830 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF2O14830 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF2O14830 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPEF2O14830 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPEF2O14830 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms