Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLIM4O00461 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLIM4O00461 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLIM4O00461 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms