Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC01387J3KSC0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC01387J3KSC0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms