Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
C6orf229H3BNL8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C6orf229H3BNL8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms