Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD8-MDP1E9PL57 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD8-MDP1E9PL57 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms