Protein–RNA interactions for Protein: D3W0D1

KLRF2, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF2D3W0D1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLRF2D3W0D1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLRF2D3W0D1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms