Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KRBOX1C9JBD0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRBOX1C9JBD0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRBOX1C9JBD0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRBOX1C9JBD0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRBOX1C9JBD0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRBOX1C9JBD0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRBOX1C9JBD0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRBOX1C9JBD0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRBOX1C9JBD0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KRBOX1C9JBD0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
KRBOX1C9JBD0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRBOX1C9JBD0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
KRBOX1C9JBD0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms