Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ERVV-2B6SEH9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERVV-2B6SEH9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms