Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms