Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MVJ9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MVJ9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MVJ9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MVJ9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
A8MVJ9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MVJ9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MVJ9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MVJ9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MVJ9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
A8MVJ9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
A8MVJ9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MVJ9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MVJ9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MVJ9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MVJ9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MVJ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MVJ9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MVJ9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MVJ9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MVJ9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MVJ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
A8MVJ9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
A8MVJ9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
A8MVJ9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
A8MVJ9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
A8MVJ9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A8MVJ9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
A8MVJ9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
A8MVJ9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms