Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NOTOA8MTQ0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NOTOA8MTQ0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms