Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NEURL1BA8MQ27 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NEURL1BA8MQ27 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms