Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KNCNA6PVL3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KNCNA6PVL3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms