Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYNDIG1LA6NDD5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms