Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC66A2RUB6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC66A2RUB6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms