Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PQD8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PQD8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PQD8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A1W2PQD8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A1W2PQD8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQD8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQD8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQD8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQD8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQD8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQD8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQD8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQD8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQD8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A1W2PQD8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms