Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQS6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQS6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A0A0U1RQS6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
A0A0U1RQS6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms