Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYL6

RPL17-C18orf32, Protein RPL17-C18orf32, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
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RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
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RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
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RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
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RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
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RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
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RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
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RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
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RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
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RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
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