Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
V9GYV3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
V9GYV3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
V9GYV3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
V9GYV3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
V9GYV3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms