Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC36■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC36■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC36■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC35.89■■■■□ 3.34
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
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