Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJA3Q9Y6H8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJA3Q9Y6H8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.1 ms