Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARFGEF1Q9Y6D6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms