Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDHB2Q9Y5E7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCDHB2Q9Y5E7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHB2Q9Y5E7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCDHB2Q9Y5E7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB2Q9Y5E7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB2Q9Y5E7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB2Q9Y5E7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB2Q9Y5E7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB2Q9Y5E7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB2Q9Y5E7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB2Q9Y5E7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCDHB2Q9Y5E7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms