Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC41.43■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC41.42■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.22
DCAF1Q9Y4B6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.38■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.38■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC41.37■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC41.37■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC41.36■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC41.35■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC41.34■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC41.34■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
DCAF1Q9Y4B6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
DCAF1Q9Y4B6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
DCAF1Q9Y4B6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC41.32■■■■■ 4.2
DCAF1Q9Y4B6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
DCAF1Q9Y4B6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
DCAF1Q9Y4B6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC41.31■■■■■ 4.2
DCAF1Q9Y4B6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
DCAF1Q9Y4B6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
DCAF1Q9Y4B6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
DCAF1Q9Y4B6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
DCAF1Q9Y4B6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
DCAF1Q9Y4B6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
DCAF1Q9Y4B6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms