Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRPL11Q9Y3B7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL11Q9Y3B7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms