Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP20Q9Y2K6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP20Q9Y2K6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms